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1、
equivalently
2、
关于Fastq格式的一些想法
1、
equivalently
英：【ɪˈkwɪvələntli】美：【ɪˈkwɪvələntli】
英：
美：
常用释义：
相等地
adv.相等地；相当于
1、Simple USES of ARRAY_AGG can be expressed
equivalently
using array constructors by query.───使用通过查询的阵列构造函数可以等效地表示ARRAY_AGG的简单使用。
2、So we conclude that the bending of light that we found in the accelerated system does indeed apply
equivalently
to a gravitational field.───所以，我们断定，我们在加速系统里面发现的光线的弯曲确实和一个重力场中的相等价。
3、Equivalently, it means how much the first (left or top) margin will grow.───同样，这意味着第一个边距（左边距或上边距）将增长多少。
4、We therefore reject our hypothesis that these 4 constructs would function
equivalently
.───因此，我们拒绝先前关于4种装置在功能上等同的假设。
5、The services composition plan was transferred into an AOV graph
equivalently
, and then was transformed into a binary tree further.───首先将一个服务的组合方案等效成AOV图，并将其转换成二叉树，然后进行后续遍历并编码。
6、Equivalently, the determinant of the second fundamental form of a surface in R 3 can be so expressed.───等价地，嵌入在R3中的曲面的第二基本形式的行列式也可以这样表达。
7、Equivalently , it rejects, if, no matter what transitions are applied, it would not end in an accepting state.───等价的说，它拒绝这个字符串，如果不管应用什么转移，它都不能结束于接受状态。
8、In the process, risk is valued, and riskier stocks and assets must sell for a lower price (or,
equivalently
, earn a higher average return).───在这个过程中，风险被赋予了价值，风险股票和资产只能以较低的价位出售（或者说，获得较高的平均收益）。
1、equivalency───n.等价；相等（等于equivalence）
2、ambivalently───犹豫不决地
3、equivalent───adj.（在价值、数量等方面）相等的；等价的；等效的；等量的；同意义的；n.对等的人（或事物）；当量
4、covalently───共价的（covalent的变体）
5、equipollently───相等地
6、equivalence───n.等价；相等；等值
7、quadrivalently───四价的
8、equivalents───n.【化学】当量（equivalent的复数）；同等设备；等同物
9、prevalently───adv.流行地，普遍地
2、
关于Fastq格式的一些想法
FASTQ是基于文本的，保存生物序列（通常是核酸序列）和其测序质量信息的标准格式。其序列以及质量信息都是使用一个ASCII字符标示，最初由Sanger开发，目的是将FASTA序列与质量数据放到一起，目前已经成为高通量测序结果的事实标准。
FASTQ文件中每个序列通常有四行：
例如：
@SEQ_ID
GATTTGGGGTTCAAAGCAGTATCGATCAAATAGTAAATCCATTTGTTCAACTCACAGTTT
++
! ((((
+))%%%++)(%%%%).1
-+ ))**55CCF>>>>>>CCCCCCC65
质量评分指的是一个碱基的错误概率的对数值。其最初在Phred拼接软件中定义与使用，其后在许多软件中得到使用。其质量得分与错误概率的对应关系见下表：
Phred quality scores are logarithmically linked to error probabilities
Phred quality scores Q are defined as a property which is logarithmically related to the base-calling error probabilities P.
除了Phred质量得分换算标准，还有就是Solexa标准：
Relationship between Q and p using the Sanger (red) and Solexa (black) equations (described above). The vertical dotted line indicates p = 0.05, or equivalently, Q ≈ 13.
对于每个碱基的质量编码标示，不同的软件采用不同的方案，目前有5种方案：
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS.....................................................
..........................XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX......................
...............................IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII......................
.................................JJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJ......................
LLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLL....................................................
!"#$%&()*+,-./0123456789:;?@ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ【】^_`abcdefghijklmnopqrstuvwxyz{}~
没有特别的规定，通常使用.fq, .fastq, .txt等
FASTQ格式的序列一般都包含有四行，第一行由@开始，后面跟着序列的描述信息，这点跟FASTA格式是一样的。第二行是序列。第三行由+开始，后面也可以跟着序列的描述信息。第四行是第二行序列的质量评价（quality values，注：应该是测序的质量评价），字符数跟第二行的序列是相等的。
FASTQ格式例子：
@SEQ_ID
GATTTGGGGTTCAAAGCAGTATCGATCAAATAGTAAATCCATTTGTTCAACTCACAGTTT
++
! ((((
+))%%%++)(%%%%).1
-+ ))**55CCF>>>>>>CCCCCCC65
例如在NCBI看到的FASTQ格式如下：
@SRR001666.1 071112_SLXA-EAS1_s_7:5:1:817:345 length=36
GGGTGATGGCCGCTGCCGATGGCGTCAAATCCCACC
+SRR001666.1 071112_SLXA-EAS1_s_7:5:1:817:345 length=36
IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII9IG9IC
FASTQ格式与Fasta格式、GenBank等格式的相互转换